El jardín contiene 350 ejemplares de flora nativa. El 90% de las plantas fueron propagadas por semilla colectadas ex profeso.
El Jardín colabora con ejidos y comunidades para intercambiar conocimientos sobre la flora de Jalisco.
Las actividades incluyen la colecta permanente de ejemplares en la región Valles y sierra Occidental y propagación en las instalaciones del Jardín Etnobiológico de Jalisco (laboratorio e invernaderos).
Se desarrollan proyectos de investigación para la conservación de especies. Estudiantes de la Ingeniería en Sistemas Biológicos realizan su tesis sobre agaves y pinos.